A partir du moment ou ce n'est ni la semaine (base légale du Code du Travail), ni la quatorzaine (décret 2003-1242), oui il faut obligatoirement un texte qui précise sur quelle durée le temps de travail est calculé.
Mais ce n'est pas obligatoirement un accord d'entreprise (sauf si le système a été mis en place à compter du 21 aout 2008), et il peut être écrit par exemple dans le contrat de travail ou le règlement intérieur