Bonjour,
Je ne sais pas comment ta DRH à pu te dire que si tu prenais 3 semaines cela te décompterai 17 jours au lieu de 16....
Le fait que tes congés soit en dehors de la période légale (les deux semaines de novembre en tout cas) peut éventuellement entrainer des jours supplémentaires dit jours de fractionnement. Mais ces jours, c'est des jours en plus et certainement pas en moins.
Perso, quand j'ai un doute, j'utilise une calculette à congés payés
http://www.gestiondelapaie.com/decompte_conges/decompte_conges.php
Si ta DRH continue à affirmer 17 au lieu de 16, demande lui de se justifier par écrit. Et si tu obtiens cet écris, transmet le à l'inspection du travail.